A Xiloteca UBw conta com mais de 900 amostras de madeiras majoritariamente nativas, principalmente do planalto central e do bioma Cerrado. Aqui são depositados principalmente materiais relativos a projetos de pesquisa que tem relação com a anatomia da madeira. Além das madeiras, o acervo conta com uma coleção de lâminas histológicas, utilizadas para identificação, pesquisas e uso didático.

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