O acervo ictiológico depositado hoje no MHNCI surgiu em 1935, com o lançamento
do plano de reorganização do antigo Museu Paranaense, este inaugurado em 1876,
o terceiro do gênero no País. Em 1963, o acervo foi transferido para a sede no
bairro Capão da Imbuia em Curitiba, onde permanece até hoje. O MHNCI é
atualmente uma divisão do Departamento de Zoológico da Secretaria Municipal do
Meio Ambiente da Prefeitura de Curitiba, que além da realizar pesquisas
científicas e atividades de educação ambiental, mantém um banco de dados
zoológico que se constitui no melhor documento de história natural do Paraná.
Todas as coleções zoológicas do Museu destinam-se à pesquisa
científica. Os acervos estão tombados como Patrimônio Histórico e Artístico do
Paraná (Lei Estadual 1211, de 16/09/1953), e a sede constitui Unidade de
Conservação Municipal (Decreto Municipal 252, de 10/05/1994). O Museu está
também credenciado como Instituição Pública Nacional de Pesquisa e
Desenvolvimento como fiel depositária de amostra de componente do patrimônio
genético (D.O.U. de 8/03/2005).
A coleção de peixes do MHNCI é caracteriza como de importância
regional, pois apresenta informações sobre a ictiofauna marinha do litoral do
Paraná e Santa Catarina, e de água-doce dos principais rios do estado do
Paraná, além dos riachos litorâneos da Floresta Atlântica do litoral paranaense
e catarinense. Essa coleção tem sido utilizada por eminentes pesquisadores
brasileiros e estrangeiros, tanto para estudos de biodiversidade e revisões
taxonômicas, como para depósito de material zoológico proveniente de atividades
científicas devidamente autorizadas. Na área de ensino a coleção serve de
treinamento para estagiários de todas as instituições públicas e privadas do
Paraná, além de dar suporte a dissertações e teses de estudantes de importantes
cursos de pós-graduação nacional (MNRJ, PUC-RS, UFPR, UEM, UEL, UNESP, MZUSP).
Além disso, entre os beneficiários destacam-se ainda os vários agentes
envolvidos na administração de Unidades de Conservação e no estudo do status
das espécies brasileiras de peixes ameaçados de extinção.

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